Windowsta ssh bağlantı yapmanın benim bildiğim tek yolu Putty. Putty genel olarak başarılı bir program olmakla birlikte bazı özellikleri fazla yalın.
Bu yüzden altta putty çalışmakla birlikte ekstra özellikler taşıyan programlar çıkmış durumda.
Benim bulabildiklerim içinde iki tanesini beğendim.

1- MTputty (Multithreaded Putty, MultiTabbed Putty)

Özetle putty’ye aynı anda çok sayıda tab açabilme ve düzenli bağlandığınız serverlari kaydedebilme gibi özellikler getirmiş hafif bir program. İsterseniz bağlanacağınız serverin parolasınıda kaydedebiliyorsunuz. Ama SSH ile bağlanma gereğini duyduğunuz bir serverin parolasini windows altında erişilebilir bir dosyada saklamak sizin tercihiniz.

Portable versiyonuda var. USB’ye yada dropbox tarzı bir paylaşım sisteminede kurmak mümkün.

2- MobaTerm
Bu seçenek bir öncekinin aksine tam teşekküllü ağır top cinsinden.
Putty alternatifinden çok windows altında küçük çaplu bir Linux ortamı demek daha sağlıklı olacaktır.
Başrolde zaten CygWin var.
Alta cygwin attıktan sonra üzerine SSH, RDP, SFTP, FTP  vb pek çok bağlantı tipi için gerekli yan uygulamları kuruyor.
vi’dan tutun bazı  oyunlara kadar bir ton araç gereçle geliyor.
Networkte packet dinlemeye kadar pek çok şey var (TCP capture).

Kişisel kullanım için olan sürüm çoğu kullanıcıya yeter artar. Ama paralı sürüme geçecek olursanız bazı kısıtlamalar kalkıyor.
sitesinde ayrıntılı çetele var; http://mobaxterm.mobatek.net/download.html

Başlamışken MobaSSH‘dan da bahsetmek gerekli. Buda windowsa SSH kurabilmenizi sağlayan bir uygulama.
Bu sayede bir windows makineye uzaktan erişim gerektiğinde RDP değilde SSH seçeneğine -ve gücüne- kavuşabileceksiniz.
http://mobassh.mobatek.net/